#22 COVID-19 증폭 실험 : Genomic Pub

실험 레시피

[Real Time PCR]#22 COVID-19 증폭 실험

김민지

2022-03-21

1. 개요 및 목적

2019년 중국 우한에서 시작으로 중국과 전 세계적으로 확산된 호흡기 감염질환인 COVID-19는, 감염자로부터 나오는 비말이 호흡기 또는 눈, 코, 입을 통해 전염이 된다. COVID의 유전자는 ORD8, N, E, RdRp등으로 다양하지만, 이 실험에서는 GeneProof사의 SARS-CoV-2 Advanced PCR Kit를 사용해 RdRp, E. N 유전자를 증폭하는 실험이며, DNA가 아닌 RNA를 증폭하는 실험이다.

2. 실험 재료 및 기기

실험재료

- GeneProof SARS-CoV-2 Advanced PCR Kit, COVID-19 RNA, dH₂0

실험기기

- Real Time PCR System (ex. QuantStudio5 - ABI, Thermo Fisher Scientific, USA)

3. 실험 방법 및 절차

① COVID 표준물질 RNA를 10배씩 희석한다.

	Sample 1 (10⁴ copies/uL)	Sample 2 (10³ copies/uL)	Sample 3 (10² copies/uL)	Sample 4 (10¹ copies/uL)	Sample 5 (10⁰ copies/uL)
RNA	10⁵RNA 2 uL	Sample 1 2 uL	Sample 2 2 uL	Sample 3 2 uL	Sample 4 2 uL
dH₂O	18 uL	18 uL	18 uL	18 uL	18 uL
Total	20 uL	20 uL	20 uL	20 uL	20 uL

② PCR 샘플 시약 조성

	Sample 1~5	N.C.
Master Mix*	15 uL	15 uL
RNA	10 uL	-
dH₂O	-	10 uL
Total	25 uL	25 uL

* Master Mix에 Primer와 Probe가 포함되어 있다.

4. 실험 결과와 결과의 해석

- Sample 1 (10⁴ copies/uL) 그래프 - Sample 2 (10³ copies/ uL) 그래프

- Sample 3 (10² copies/uL) - Sample 4 (10¹ copies/ uL)

- Sample 5 (10⁰ copies/ uL)

- N.C.

-결과 해석

RdRp gene은 FAM 형광에서 증폭하는 것을 확인했고, E gene 과 N gene은 CY5 형광에서 증폭을 확인이 되었다.
IC는 HEX에서 확인을 할 수 있는데, IC는 The human RNase P gene을 target으로 보는데 이 실험에서는 dH₂O를 N.C. 샘플로 사용을 했기 때문에 증폭을 하지 않았다.
*음성검체를 사용 할 경우, 밑에 그래프와 같은 결과를 확인 할 수 있다.