1. 개요 및 목적
1. 개요 및 목적
HPV(Human papillomavirus)는 인간 유두종바이러스라고 하며 DNA 기반의 바이러스로 사람을 비롯한 여러 동물의 피부나 피하에 감염된다.
현재 130여종의 바이러스가 발견되었으며 그 중 HPV16, 18이 전 세계 자궁경부암 환자의 70%에서 발견되고 있는 고위험군이다.
Conventional PCR을 통해 이 두 타입의 DNA를 증폭시키고 전기영동을 통해 결과를 확인해 볼 수 있다.
2.실험 재료 및 기기
2. 실험 재료 및 기기
실험 재료
*Taq polymerase (1unit/ul), 10X taq buffer, **dNTP mix (25mM), HPV Primer set (Forward, Reverse), HPV16, 18 DNA, dH2O,
DNA ladder
*Taq polymerase: Thermus aquaticus라는 미생물에서 유래한 중합효소로 열에 안정적이며 DNA를 합성하는 효소이다.
**dNTP: 핵산의 구성 성분으로 중합효소가 DNA를 합성할 때 기질 역할을 한다. dNTP는 단순한 PCR 반응의 구성 요소 역할 뿐 아니라 중합효소가
핵산을 합성하는데 필요한 에너지를 제공하는 역할도 한다.
HPV_F: TTTGTTACTGTGGTAGATACCAC
HPV_R: GAAAAATAAACTGTAAATCATATTC
실험 기기
Conventional PCR (ex.DuxCycler-바이오메듀스)
DNA Electrophoresis (ex.DuxGeldoc- 바이오메듀스,한국)
3. 실험 방법 및 절차
3. 실험 방법 및 절차
① HPV16, 18 DNA를 10배씩 희석하여 준비한다.
| Sample 1 | Sample 2 | Sample 3 | Sample 4 | Sample 5 | Sample 6 | Sample 7 |
---|
DNA | DNA 2ul | Sample 1의 DNA 2ul | Sample 2의 DNA 2ul | Sample 3의 DNA 2ul | Sample 4의 DNA 2ul | Sample 5의 DNA 2ul | Sample 6의 DNA 2ul |
dH2O | 18ul | 18ul | 18ul | 18ul | 18ul | 18ul | 18ul |
Total | 20ul | 20ul | 20ul | 20ul | 20ul | 20ul | 20ul |
② PCR 샘플 시약 조성
| Sample 1~7 | N.C. |
---|
Taq polymerase | 0.5ul | 0.5ul |
10X taq buffer | 2ul | 2ul |
dNTP | 0.08ul | 0.08ul |
HPV_F (10pmole) | 0.1ul | 0.1ul |
HPV_R (10pmole) | 1ul | 1ul |
HPV16, 18 DNA | 4.5ul | - |
dH2O | 11.82ul | 16.32ul |
Total | 20ul | 20ul |
③ PCR 조건에 맞춰 기기를 세팅한다.
단계 | 온도 | 시간 | 사이클 |
---|
초기 변성 | 95℃ | 12:00 | 1 |
변성 | 94℃ | 00:30 | 40 |
결합 | 50℃ | 01:00 |
신장 | 72℃ | 00:30 |
최종 신장 | 72℃ | 05:00 | 1 |
4. 실험 결과
4. 실험 결과
5. 주의 사항
5. 주의 사항
1) 실험 도중 DNA나 PCR 시약이 오염되지 않도록 파이펫팅에 주의를 기울인다.
2) 실험 방법 중 온도나 시약 양을 틀리지 않게 주의하여 실험한다.
#HPV #Taq polymerase #dNTP
이경진 연구원
경기도 수원시 영통구 대학4로 17 (이의동) 에이스광교타워1 3층 308호
Tel.(+82)031-899-8620 Fax.(+82)031-899-8621
E-mail. biomedux@biomedux.com
목차
1.개요 및 목적
2. 실험 재료 및 기기
3. 실험 방법 및 절차
4. 실험 결과
5. 주의 사항
1. 개요 및 목적
1. 개요 및 목적
HPV(Human papillomavirus)는 인간 유두종바이러스라고 하며 DNA 기반의 바이러스로 사람을 비롯한 여러 동물의 피부나 피하에 감염된다.
현재 130여종의 바이러스가 발견되었으며 그 중 HPV16, 18이 전 세계 자궁경부암 환자의 70%에서 발견되고 있는 고위험군이다.
Conventional PCR을 통해 이 두 타입의 DNA를 증폭시키고 전기영동을 통해 결과를 확인해 볼 수 있다.
2.실험 재료 및 기기
2. 실험 재료 및 기기
실험 재료
*Taq polymerase (1unit/ul), 10X taq buffer, **dNTP mix (25mM), HPV Primer set (Forward, Reverse), HPV16, 18 DNA, dH2O,
DNA ladder
*Taq polymerase: Thermus aquaticus라는 미생물에서 유래한 중합효소로 열에 안정적이며 DNA를 합성하는 효소이다.
**dNTP: 핵산의 구성 성분으로 중합효소가 DNA를 합성할 때 기질 역할을 한다. dNTP는 단순한 PCR 반응의 구성 요소 역할 뿐 아니라 중합효소가
핵산을 합성하는데 필요한 에너지를 제공하는 역할도 한다.
HPV_F: TTTGTTACTGTGGTAGATACCAC
HPV_R: GAAAAATAAACTGTAAATCATATTC
실험 기기
Conventional PCR (ex.DuxCycler-바이오메듀스)
DNA Electrophoresis (ex.DuxGeldoc- 바이오메듀스,한국)
3. 실험 방법 및 절차
3. 실험 방법 및 절차
① HPV16, 18 DNA를 10배씩 희석하여 준비한다.
DNA 2ul
DNA 2ul
DNA 2ul
DNA 2ul
DNA 2ul
DNA 2ul
② PCR 샘플 시약 조성
③ PCR 조건에 맞춰 기기를 세팅한다.
4. 실험 결과
4. 실험 결과
5. 주의 사항
5. 주의 사항
1) 실험 도중 DNA나 PCR 시약이 오염되지 않도록 파이펫팅에 주의를 기울인다.
2) 실험 방법 중 온도나 시약 양을 틀리지 않게 주의하여 실험한다.
#HPV #Taq polymerase #dNTP
이경진 연구원
경기도 수원시 영통구 대학4로 17 (이의동) 에이스광교타워1 3층 308호
Tel.(+82)031-899-8620 Fax.(+82)031-899-8621
E-mail. biomedux@biomedux.com